El Colegio presta un servicio a los alumnos más necesitados en sus capacidades, físicas y psíquicas a través de las aulas de integración.

Este servicio atiende de forma individualizada a aquellos alumnos que se les considera beneficiarios del mismo.

Estos alumnos siguen un programa personal de aprendizaje y el objetivo del mismo es compaginar aprendizaje e integración social en el ámbito de la escuela.

Su funcionamiento es dentro del horario escolar completo. Este servicio está atendido por un equipo de profesionales y psicólogos.

El Colegio tiene autorizado y en funcionamiento un servicio de apoyo escolar en formas de apoyo individualizado o de diversificación.

Estos alumnos son desde 3º de infantil hasta 4º de la ESO.

Se atiende en virtud de necesidades, edades y posibilidades de seguimiento y atención personalizada. El objetivo de este servicio es prevenir, frenar y en su caso superar el fracaso escolar.

Los alumnos que se benefician de este servicio son orientados y aconsejados por el Departamento de orientación a propuesta de sus tutores y profesores correspondientes. El profesorado que presta este servicio es el mismo profesorado del colegio y siempre dentro del horario escolar.

El colegio organiza transporte escolar desde Barruelo, Cervera de Pisuerga y Herrera- Alar.

Este servicio se engloba desde la iniciativa histórica del colegio de atender a los alumnos y sus familias de las zonas cercanas a Aguilar y que desean el tipo de educación menesiana.

Este servicio está atendido por las empresas de transporte escolar, Donato y Duque en Barruelo de Santullán y Cervera de Pisuerga respectivamente.